Gegeneraliseerde mycosen worden in Nederland uitsluitend veroorzaakt door opportunistische schimmels en gisten, die slechts bij personen met een gestoorde gastweerstand (bijvoorbeeld immuundepressie na orgaantransplantatie, intensievere chemotherapie bij patiënten met kwaadaardige aandoeningen, AIDS) tot infecties kunnen leiden. De belangrijkste verwekkers zijn Candida spp., Aspergillus spp , Cryptococcus neoformans.